Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNC1Q01954 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BNC1Q01954 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BNC1Q01954 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BNC1Q01954 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms