Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPIBQ01892 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPIBQ01892 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPIBQ01892 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms