Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MDM2Q00987 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MDM2Q00987 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MDM2Q00987 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms