Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PPP2R2BQ00005 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PPP2R2BQ00005 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms