Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VLDLRP98155 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VLDLRP98155 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VLDLRP98155 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms