Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX1P83916 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBX1P83916 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX1P83916 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX1P83916 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX1P83916 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBX1P83916 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX1P83916 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX1P83916 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX1P83916 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX1P83916 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX1P83916 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX1P83916 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX1P83916 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX1P83916 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX1P83916 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX1P83916 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBX1P83916 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX1P83916 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX1P83916 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX1P83916 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX1P83916 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX1P83916 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX1P83916 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBX1P83916 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX1P83916 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX1P83916 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX1P83916 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX1P83916 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBX1P83916 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBX1P83916 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBX1P83916 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CBX1P83916 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBX1P83916 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBX1P83916 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBX1P83916 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX1P83916 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX1P83916 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBX1P83916 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX1P83916 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX1P83916 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX1P83916 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX1P83916 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBX1P83916 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX1P83916 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX1P83916 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX1P83916 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX1P83916 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX1P83916 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX1P83916 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX1P83916 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX1P83916 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX1P83916 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBX1P83916 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX1P83916 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX1P83916 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX1P83916 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX1P83916 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX1P83916 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX1P83916 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX1P83916 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBX1P83916 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX1P83916 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX1P83916 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX1P83916 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX1P83916 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX1P83916 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBX1P83916 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX1P83916 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX1P83916 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX1P83916 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX1P83916 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX1P83916 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX1P83916 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX1P83916 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX1P83916 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX1P83916 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX1P83916 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBX1P83916 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX1P83916 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBX1P83916 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX1P83916 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX1P83916 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX1P83916 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX1P83916 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBX1P83916 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms