Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTRA4P83105 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTRA4P83105 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA4P83105 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms