Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
IRX3P78415 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX3P78415 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX3P78415 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX3P78415 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX3P78415 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX3P78415 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
IRX3P78415 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX3P78415 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX3P78415 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX3P78415 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX3P78415 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX3P78415 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
IRX3P78415 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX3P78415 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX3P78415 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX3P78415 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX3P78415 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRX3P78415 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX3P78415 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX3P78415 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX3P78415 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX3P78415 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX3P78415 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRX3P78415 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRX3P78415 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRX3P78415 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRX3P78415 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRX3P78415 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRX3P78415 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRX3P78415 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRX3P78415 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRX3P78415 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRX3P78415 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IRX3P78415 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IRX3P78415 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRX3P78415 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRX3P78415 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRX3P78415 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRX3P78415 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRX3P78415 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRX3P78415 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX3P78415 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX3P78415 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX3P78415 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX3P78415 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX3P78415 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX3P78415 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX3P78415 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRX3P78415 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRX3P78415 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRX3P78415 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRX3P78415 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRX3P78415 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRX3P78415 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRX3P78415 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRX3P78415 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRX3P78415 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX3P78415 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX3P78415 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX3P78415 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX3P78415 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX3P78415 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX3P78415 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX3P78415 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX3P78415 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX3P78415 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX3P78415 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX3P78415 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX3P78415 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX3P78415 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX3P78415 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX3P78415 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX3P78415 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX3P78415 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX3P78415 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX3P78415 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX3P78415 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX3P78415 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX3P78415 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX3P78415 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX3P78415 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX3P78415 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX3P78415 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX3P78415 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX3P78415 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX3P78415 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX3P78415 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX3P78415 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms