Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ASIC1P78348 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ASIC1P78348 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ASIC1P78348 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms