Protein–RNA interactions for Protein: P62979

RPS27A, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP62979 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPS27AP62979 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPS27AP62979 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms