Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNG7P62955 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNG7P62955 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNG7P62955 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms