Protein–RNA interactions for Protein: P61956

SUMO2, Small ubiquitin-related modifier 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO2P61956 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO2P61956 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO2P61956 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms