Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCALDP61601 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCALDP61601 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCALDP61601 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCALDP61601 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCALDP61601 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCALDP61601 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCALDP61601 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCALDP61601 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCALDP61601 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCALDP61601 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCALDP61601 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCALDP61601 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCALDP61601 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCALDP61601 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCALDP61601 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCALDP61601 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCALDP61601 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCALDP61601 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCALDP61601 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCALDP61601 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCALDP61601 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCALDP61601 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCALDP61601 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCALDP61601 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCALDP61601 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCALDP61601 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCALDP61601 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCALDP61601 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCALDP61601 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCALDP61601 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCALDP61601 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCALDP61601 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCALDP61601 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCALDP61601 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCALDP61601 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCALDP61601 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCALDP61601 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCALDP61601 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCALDP61601 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCALDP61601 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCALDP61601 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCALDP61601 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCALDP61601 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCALDP61601 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCALDP61601 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCALDP61601 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCALDP61601 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCALDP61601 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCALDP61601 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCALDP61601 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCALDP61601 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCALDP61601 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCALDP61601 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCALDP61601 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCALDP61601 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCALDP61601 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCALDP61601 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCALDP61601 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCALDP61601 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCALDP61601 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCALDP61601 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCALDP61601 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCALDP61601 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCALDP61601 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCALDP61601 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCALDP61601 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCALDP61601 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCALDP61601 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCALDP61601 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCALDP61601 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCALDP61601 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCALDP61601 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCALDP61601 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCALDP61601 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCALDP61601 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms