Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ERVK11-1P61568 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERVK11-1P61568 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms