Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTENP60484 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTENP60484 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTENP60484 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTENP60484 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTENP60484 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTENP60484 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTENP60484 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTENP60484 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTENP60484 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTENP60484 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTENP60484 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTENP60484 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTENP60484 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTENP60484 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTENP60484 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTENP60484 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTENP60484 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTENP60484 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTENP60484 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTENP60484 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTENP60484 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTENP60484 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTENP60484 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTENP60484 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTENP60484 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTENP60484 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTENP60484 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTENP60484 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTENP60484 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTENP60484 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTENP60484 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTENP60484 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTENP60484 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTENP60484 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTENP60484 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTENP60484 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTENP60484 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTENP60484 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTENP60484 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTENP60484 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTENP60484 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTENP60484 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTENP60484 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTENP60484 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTENP60484 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTENP60484 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTENP60484 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTENP60484 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTENP60484 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTENP60484 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTENP60484 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTENP60484 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTENP60484 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTENP60484 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTENP60484 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTENP60484 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTENP60484 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTENP60484 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTENP60484 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTENP60484 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTENP60484 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTENP60484 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTENP60484 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTENP60484 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTENP60484 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTENP60484 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTENP60484 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTENP60484 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTENP60484 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTENP60484 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTENP60484 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTENP60484 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTENP60484 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTENP60484 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTENP60484 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTENP60484 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTENP60484 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTENP60484 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTENP60484 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTENP60484 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTENP60484 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTENP60484 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTENP60484 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTENP60484 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTENP60484 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTENP60484 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTENP60484 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms