Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC01547P58512 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC01547P58512 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms