Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
GSDMDP57764 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GSDMDP57764 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GSDMDP57764 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms