Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB25P57735 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB25P57735 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB25P57735 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB25P57735 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB25P57735 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB25P57735 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RAB25P57735 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RAB25P57735 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB25P57735 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB25P57735 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB25P57735 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB25P57735 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB25P57735 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB25P57735 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB25P57735 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB25P57735 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB25P57735 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB25P57735 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB25P57735 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB25P57735 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB25P57735 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB25P57735 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB25P57735 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB25P57735 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB25P57735 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB25P57735 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB25P57735 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB25P57735 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB25P57735 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB25P57735 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB25P57735 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB25P57735 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB25P57735 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB25P57735 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB25P57735 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB25P57735 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB25P57735 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB25P57735 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB25P57735 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB25P57735 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB25P57735 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB25P57735 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB25P57735 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB25P57735 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB25P57735 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB25P57735 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB25P57735 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB25P57735 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB25P57735 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB25P57735 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB25P57735 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB25P57735 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB25P57735 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB25P57735 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB25P57735 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB25P57735 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB25P57735 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB25P57735 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB25P57735 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB25P57735 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms