Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB38P57729 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB38P57729 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB38P57729 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB38P57729 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB38P57729 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB38P57729 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB38P57729 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB38P57729 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB38P57729 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB38P57729 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB38P57729 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB38P57729 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB38P57729 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB38P57729 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB38P57729 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB38P57729 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB38P57729 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB38P57729 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB38P57729 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB38P57729 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB38P57729 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB38P57729 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB38P57729 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB38P57729 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB38P57729 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB38P57729 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB38P57729 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB38P57729 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB38P57729 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB38P57729 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB38P57729 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB38P57729 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB38P57729 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB38P57729 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB38P57729 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB38P57729 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB38P57729 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB38P57729 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB38P57729 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB38P57729 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB38P57729 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB38P57729 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB38P57729 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB38P57729 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB38P57729 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB38P57729 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB38P57729 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB38P57729 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB38P57729 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB38P57729 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB38P57729 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB38P57729 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB38P57729 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB38P57729 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB38P57729 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB38P57729 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB38P57729 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB38P57729 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB38P57729 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB38P57729 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB38P57729 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB38P57729 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB38P57729 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB38P57729 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB38P57729 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB38P57729 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB38P57729 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB38P57729 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB38P57729 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB38P57729 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB38P57729 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB38P57729 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB38P57729 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB38P57729 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB38P57729 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB38P57729 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB38P57729 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB38P57729 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB38P57729 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB38P57729 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB38P57729 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB38P57729 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB38P57729 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB38P57729 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB38P57729 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB38P57729 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB38P57729 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB38P57729 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms