Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBASH3AP57075 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBASH3AP57075 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBASH3AP57075 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms