Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTBP2P56545 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CTBP2P56545 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTBP2P56545 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms