Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL23P55773 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL23P55773 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL23P55773 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL23P55773 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL23P55773 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL23P55773 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCL23P55773 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCL23P55773 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCL23P55773 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL23P55773 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL23P55773 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL23P55773 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL23P55773 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL23P55773 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL23P55773 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL23P55773 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL23P55773 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL23P55773 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL23P55773 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL23P55773 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL23P55773 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL23P55773 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL23P55773 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL23P55773 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL23P55773 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL23P55773 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL23P55773 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL23P55773 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL23P55773 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL23P55773 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL23P55773 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL23P55773 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL23P55773 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL23P55773 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL23P55773 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL23P55773 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL23P55773 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL23P55773 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL23P55773 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL23P55773 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL23P55773 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL23P55773 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL23P55773 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL23P55773 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL23P55773 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL23P55773 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL23P55773 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCL23P55773 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCL23P55773 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL23P55773 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL23P55773 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL23P55773 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL23P55773 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL23P55773 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCL23P55773 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCL23P55773 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCL23P55773 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCL23P55773 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCL23P55773 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCL23P55773 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCL23P55773 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCL23P55773 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCL23P55773 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCL23P55773 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCL23P55773 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCL23P55773 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCL23P55773 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCL23P55773 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCL23P55773 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCL23P55773 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCL23P55773 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCL23P55773 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCL23P55773 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCL23P55773 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCL23P55773 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCL23P55773 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCL23P55773 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCL23P55773 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCL23P55773 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCL23P55773 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCL23P55773 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCL23P55773 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCL23P55773 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCL23P55773 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCL23P55773 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCL23P55773 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCL23P55773 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCL23P55773 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms