Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP9P55211 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP9P55211 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP9P55211 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP9P55211 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP9P55211 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP9P55211 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP9P55211 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP9P55211 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP9P55211 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CASP9P55211 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP9P55211 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP9P55211 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP9P55211 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP9P55211 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP9P55211 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP9P55211 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP9P55211 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP9P55211 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP9P55211 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CASP9P55211 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP9P55211 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP9P55211 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP9P55211 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP9P55211 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP9P55211 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP9P55211 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CASP9P55211 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP9P55211 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP9P55211 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP9P55211 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP9P55211 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP9P55211 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP9P55211 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CASP9P55211 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP9P55211 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP9P55211 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP9P55211 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP9P55211 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP9P55211 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP9P55211 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP9P55211 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP9P55211 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CASP9P55211 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP9P55211 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP9P55211 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP9P55211 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP9P55211 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP9P55211 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP9P55211 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP9P55211 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP9P55211 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CASP9P55211 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP9P55211 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP9P55211 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP9P55211 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP9P55211 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP9P55211 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP9P55211 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP9P55211 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP9P55211 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP9P55211 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP9P55211 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP9P55211 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP9P55211 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP9P55211 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP9P55211 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP9P55211 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP9P55211 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP9P55211 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP9P55211 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP9P55211 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP9P55211 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP9P55211 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP9P55211 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP9P55211 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP9P55211 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP9P55211 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP9P55211 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP9P55211 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP9P55211 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP9P55211 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP9P55211 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP9P55211 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP9P55211 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP9P55211 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP9P55211 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms