Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMP55040 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMP55040 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMP55040 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMP55040 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMP55040 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GEMP55040 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMP55040 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMP55040 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMP55040 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMP55040 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GEMP55040 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMP55040 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMP55040 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMP55040 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMP55040 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMP55040 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMP55040 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMP55040 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMP55040 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GEMP55040 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMP55040 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMP55040 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMP55040 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMP55040 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMP55040 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMP55040 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GEMP55040 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GEMP55040 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GEMP55040 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GEMP55040 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GEMP55040 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMP55040 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMP55040 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMP55040 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMP55040 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMP55040 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GEMP55040 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GEMP55040 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GEMP55040 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMP55040 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMP55040 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMP55040 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMP55040 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMP55040 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMP55040 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GEMP55040 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEMP55040 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEMP55040 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEMP55040 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEMP55040 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GEMP55040 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEMP55040 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEMP55040 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEMP55040 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEMP55040 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEMP55040 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEMP55040 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEMP55040 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GEMP55040 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEMP55040 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEMP55040 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GEMP55040 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEMP55040 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GEMP55040 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEMP55040 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEMP55040 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEMP55040 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GEMP55040 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEMP55040 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEMP55040 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEMP55040 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEMP55040 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEMP55040 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GEMP55040 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GEMP55040 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GEMP55040 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GEMP55040 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEMP55040 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEMP55040 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEMP55040 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEMP55040 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GEMP55040 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GEMP55040 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEMP55040 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GEMP55040 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEMP55040 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEMP55040 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEMP55040 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEMP55040 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GEMP55040 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEMP55040 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEMP55040 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEMP55040 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GEMP55040 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEMP55040 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEMP55040 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEMP55040 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEMP55040 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GEMP55040 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms