Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATXN3P54252 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN3P54252 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms