Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNP53814 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNP53814 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNP53814 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNP53814 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMTNP53814 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMTNP53814 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMTNP53814 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMTNP53814 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMTNP53814 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMTNP53814 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNP53814 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNP53814 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNP53814 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNP53814 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNP53814 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNP53814 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMTNP53814 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNP53814 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNP53814 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNP53814 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNP53814 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNP53814 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNP53814 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNP53814 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNP53814 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMTNP53814 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMTNP53814 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMTNP53814 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMTNP53814 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMTNP53814 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNP53814 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNP53814 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNP53814 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNP53814 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMTNP53814 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNP53814 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNP53814 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNP53814 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNP53814 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNP53814 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMTNP53814 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMTNP53814 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMTNP53814 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMTNP53814 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMTNP53814 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMTNP53814 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMTNP53814 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMTNP53814 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMTNP53814 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMTNP53814 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMTNP53814 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMTNP53814 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMTNP53814 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMTNP53814 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMTNP53814 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMTNP53814 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMTNP53814 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMTNP53814 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMTNP53814 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMTNP53814 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMTNP53814 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMTNP53814 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMTNP53814 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMTNP53814 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMTNP53814 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMTNP53814 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMTNP53814 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMTNP53814 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMTNP53814 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMTNP53814 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMTNP53814 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMTNP53814 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMTNP53814 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMTNP53814 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMTNP53814 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMTNP53814 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMTNP53814 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMTNP53814 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMTNP53814 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMTNP53814 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMTNP53814 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMTNP53814 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMTNP53814 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMTNP53814 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SMTNP53814 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMTNP53814 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMTNP53814 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMTNP53814 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMTNP53814 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMTNP53814 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMTNP53814 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMTNP53814 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMTNP53814 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMTNP53814 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMTNP53814 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMTNP53814 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMTNP53814 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMTNP53814 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMTNP53814 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms