Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX2-5P52952 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKX2-5P52952 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKX2-5P52952 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKX2-5P52952 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKX2-5P52952 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKX2-5P52952 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms