Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGDP52209 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGDP52209 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGDP52209 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGDP52209 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGDP52209 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGDP52209 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGDP52209 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGDP52209 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGDP52209 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGDP52209 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGDP52209 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGDP52209 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGDP52209 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGDP52209 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGDP52209 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGDP52209 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGDP52209 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGDP52209 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGDP52209 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGDP52209 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGDP52209 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGDP52209 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGDP52209 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGDP52209 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGDP52209 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGDP52209 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGDP52209 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGDP52209 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGDP52209 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGDP52209 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGDP52209 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGDP52209 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGDP52209 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGDP52209 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGDP52209 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGDP52209 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGDP52209 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGDP52209 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGDP52209 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGDP52209 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGDP52209 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGDP52209 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGDP52209 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGDP52209 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGDP52209 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PGDP52209 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGDP52209 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGDP52209 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGDP52209 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGDP52209 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGDP52209 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGDP52209 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGDP52209 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGDP52209 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGDP52209 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGDP52209 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGDP52209 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGDP52209 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGDP52209 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGDP52209 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGDP52209 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGDP52209 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGDP52209 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGDP52209 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGDP52209 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGDP52209 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGDP52209 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGDP52209 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGDP52209 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PGDP52209 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGDP52209 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGDP52209 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PGDP52209 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PGDP52209 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGDP52209 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGDP52209 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGDP52209 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGDP52209 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGDP52209 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGDP52209 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PGDP52209 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGDP52209 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGDP52209 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGDP52209 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGDP52209 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PGDP52209 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGDP52209 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGDP52209 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PGDP52209 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGDP52209 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGDP52209 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGDP52209 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGDP52209 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGDP52209 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGDP52209 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGDP52209 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PGDP52209 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGDP52209 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PGDP52209 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms