Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK3P51956 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK3P51956 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK3P51956 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK3P51956 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK3P51956 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK3P51956 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK3P51956 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK3P51956 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK3P51956 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK3P51956 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK3P51956 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK3P51956 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK3P51956 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK3P51956 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK3P51956 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK3P51956 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK3P51956 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK3P51956 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK3P51956 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK3P51956 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK3P51956 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK3P51956 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK3P51956 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK3P51956 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK3P51956 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK3P51956 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK3P51956 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK3P51956 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK3P51956 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK3P51956 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEK3P51956 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK3P51956 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK3P51956 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK3P51956 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK3P51956 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK3P51956 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK3P51956 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK3P51956 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK3P51956 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK3P51956 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK3P51956 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK3P51956 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK3P51956 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK3P51956 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK3P51956 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK3P51956 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK3P51956 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK3P51956 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK3P51956 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK3P51956 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK3P51956 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEK3P51956 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEK3P51956 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEK3P51956 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEK3P51956 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEK3P51956 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK3P51956 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK3P51956 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK3P51956 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK3P51956 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK3P51956 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK3P51956 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK3P51956 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK3P51956 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEK3P51956 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK3P51956 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK3P51956 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK3P51956 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK3P51956 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK3P51956 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK3P51956 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK3P51956 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK3P51956 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEK3P51956 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEK3P51956 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEK3P51956 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEK3P51956 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEK3P51956 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK3P51956 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK3P51956 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK3P51956 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK3P51956 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK3P51956 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEK3P51956 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK3P51956 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK3P51956 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK3P51956 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEK3P51956 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms