Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK2P51955 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK2P51955 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK2P51955 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEK2P51955 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEK2P51955 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK2P51955 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK2P51955 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK2P51955 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK2P51955 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK2P51955 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK2P51955 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK2P51955 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEK2P51955 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK2P51955 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK2P51955 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK2P51955 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK2P51955 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK2P51955 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK2P51955 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK2P51955 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEK2P51955 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK2P51955 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK2P51955 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK2P51955 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK2P51955 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK2P51955 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK2P51955 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK2P51955 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK2P51955 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEK2P51955 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEK2P51955 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK2P51955 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK2P51955 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK2P51955 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK2P51955 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK2P51955 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK2P51955 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK2P51955 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK2P51955 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEK2P51955 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK2P51955 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK2P51955 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK2P51955 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK2P51955 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK2P51955 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK2P51955 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK2P51955 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK2P51955 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEK2P51955 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK2P51955 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK2P51955 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK2P51955 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK2P51955 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEK2P51955 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEK2P51955 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK2P51955 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK2P51955 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK2P51955 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEK2P51955 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms