Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNHP51946 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNHP51946 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNHP51946 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNHP51946 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNHP51946 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNHP51946 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNHP51946 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNHP51946 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNHP51946 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNHP51946 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNHP51946 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNHP51946 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNHP51946 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNHP51946 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNHP51946 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNHP51946 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNHP51946 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNHP51946 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNHP51946 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNHP51946 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNHP51946 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNHP51946 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNHP51946 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNHP51946 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNHP51946 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNHP51946 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNHP51946 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNHP51946 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNHP51946 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNHP51946 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNHP51946 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNHP51946 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNHP51946 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNHP51946 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNHP51946 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNHP51946 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNHP51946 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNHP51946 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNHP51946 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNHP51946 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNHP51946 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNHP51946 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCNHP51946 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNHP51946 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNHP51946 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNHP51946 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNHP51946 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNHP51946 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNHP51946 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNHP51946 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNHP51946 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNHP51946 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNHP51946 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNHP51946 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNHP51946 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNHP51946 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNHP51946 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNHP51946 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNHP51946 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNHP51946 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNHP51946 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNHP51946 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNHP51946 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNHP51946 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNHP51946 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNHP51946 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCNHP51946 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNHP51946 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNHP51946 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCNHP51946 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms