Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLCN2P51788 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCN2P51788 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCN2P51788 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms