Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCR4P51679 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCR4P51679 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCR4P51679 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCR4P51679 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCR4P51679 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCR4P51679 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCR4P51679 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCR4P51679 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCR4P51679 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCR4P51679 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCR4P51679 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCR4P51679 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCR4P51679 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCR4P51679 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCR4P51679 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCR4P51679 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCR4P51679 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCR4P51679 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCR4P51679 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCR4P51679 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCR4P51679 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCR4P51679 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCR4P51679 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCR4P51679 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCR4P51679 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCR4P51679 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR4P51679 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR4P51679 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR4P51679 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR4P51679 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR4P51679 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR4P51679 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR4P51679 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR4P51679 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR4P51679 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR4P51679 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCR4P51679 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCR4P51679 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCR4P51679 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR4P51679 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR4P51679 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCR4P51679 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR4P51679 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR4P51679 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR4P51679 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR4P51679 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR4P51679 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR4P51679 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR4P51679 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR4P51679 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR4P51679 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCR4P51679 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms