Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRP9P49458 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP9P49458 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP9P49458 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP9P49458 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP9P49458 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP9P49458 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP9P49458 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRP9P49458 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SRP9P49458 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRP9P49458 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SRP9P49458 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SRP9P49458 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SRP9P49458 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP9P49458 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP9P49458 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP9P49458 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP9P49458 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP9P49458 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP9P49458 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP9P49458 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP9P49458 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP9P49458 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP9P49458 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SRP9P49458 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP9P49458 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP9P49458 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP9P49458 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP9P49458 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP9P49458 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP9P49458 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP9P49458 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SRP9P49458 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP9P49458 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP9P49458 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP9P49458 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP9P49458 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP9P49458 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP9P49458 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP9P49458 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP9P49458 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP9P49458 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP9P49458 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SRP9P49458 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP9P49458 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP9P49458 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP9P49458 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP9P49458 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP9P49458 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SRP9P49458 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms