Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POU3F4P49335 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POU3F4P49335 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms