Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CSN1S1P47710 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSN1S1P47710 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms