Protein–RNA interactions for Protein: P46059

SLC15A1, Solute carrier family 15 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC15A1P46059 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC15A1P46059 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC15A1P46059 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms