Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF5P43026 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF5P43026 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF5P43026 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF5P43026 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF5P43026 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF5P43026 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF5P43026 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF5P43026 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF5P43026 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF5P43026 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GDF5P43026 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDF5P43026 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDF5P43026 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF5P43026 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF5P43026 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF5P43026 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF5P43026 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF5P43026 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF5P43026 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF5P43026 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF5P43026 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF5P43026 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF5P43026 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF5P43026 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF5P43026 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF5P43026 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF5P43026 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF5P43026 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF5P43026 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF5P43026 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF5P43026 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF5P43026 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF5P43026 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF5P43026 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF5P43026 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF5P43026 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF5P43026 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF5P43026 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF5P43026 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF5P43026 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF5P43026 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF5P43026 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF5P43026 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF5P43026 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF5P43026 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF5P43026 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF5P43026 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDF5P43026 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF5P43026 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF5P43026 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF5P43026 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF5P43026 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF5P43026 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF5P43026 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF5P43026 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF5P43026 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF5P43026 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF5P43026 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF5P43026 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF5P43026 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF5P43026 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF5P43026 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF5P43026 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF5P43026 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF5P43026 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF5P43026 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF5P43026 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF5P43026 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF5P43026 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF5P43026 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF5P43026 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF5P43026 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms