Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA2P42765 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA2P42765 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA2P42765 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA2P42765 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA2P42765 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA2P42765 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA2P42765 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA2P42765 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACAA2P42765 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACAA2P42765 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACAA2P42765 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACAA2P42765 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA2P42765 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA2P42765 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA2P42765 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA2P42765 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACAA2P42765 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACAA2P42765 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA2P42765 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA2P42765 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACAA2P42765 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACAA2P42765 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAA2P42765 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAA2P42765 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACAA2P42765 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAA2P42765 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAA2P42765 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACAA2P42765 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACAA2P42765 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACAA2P42765 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms