Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIA2P42262 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA2P42262 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA2P42262 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIA2P42262 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.5 ms