Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC26A3P40879 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC26A3P40879 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC26A3P40879 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms