Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX2P40425 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX2P40425 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX2P40425 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX2P40425 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX2P40425 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PBX2P40425 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX2P40425 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX2P40425 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX2P40425 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX2P40425 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX2P40425 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX2P40425 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX2P40425 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX2P40425 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PBX2P40425 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX2P40425 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX2P40425 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX2P40425 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PBX2P40425 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX2P40425 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX2P40425 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX2P40425 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX2P40425 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PBX2P40425 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX2P40425 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX2P40425 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX2P40425 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX2P40425 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX2P40425 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PBX2P40425 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PBX2P40425 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX2P40425 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX2P40425 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX2P40425 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX2P40425 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX2P40425 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX2P40425 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PBX2P40425 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBX2P40425 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBX2P40425 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBX2P40425 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBX2P40425 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBX2P40425 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PBX2P40425 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBX2P40425 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBX2P40425 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBX2P40425 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PBX2P40425 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX2P40425 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX2P40425 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX2P40425 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX2P40425 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX2P40425 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PBX2P40425 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX2P40425 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX2P40425 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX2P40425 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX2P40425 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX2P40425 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX2P40425 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX2P40425 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PBX2P40425 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX2P40425 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX2P40425 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX2P40425 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX2P40425 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX2P40425 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX2P40425 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX2P40425 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX2P40425 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PBX2P40425 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX2P40425 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX2P40425 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX2P40425 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PBX2P40425 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBX2P40425 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBX2P40425 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PBX2P40425 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX2P40425 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX2P40425 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PBX2P40425 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX2P40425 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX2P40425 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX2P40425 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX2P40425 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX2P40425 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX2P40425 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PBX2P40425 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PBX2P40425 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms