Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZEB1P37275 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZEB1P37275 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZEB1P37275 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZEB1P37275 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms