Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHRNA7P36544 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNA7P36544 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNA7P36544 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms