Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCK1P35558 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCK1P35558 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCK1P35558 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCK1P35558 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCK1P35558 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCK1P35558 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCK1P35558 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCK1P35558 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCK1P35558 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCK1P35558 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCK1P35558 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCK1P35558 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCK1P35558 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCK1P35558 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCK1P35558 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCK1P35558 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCK1P35558 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCK1P35558 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCK1P35558 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCK1P35558 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCK1P35558 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCK1P35558 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCK1P35558 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCK1P35558 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCK1P35558 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCK1P35558 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCK1P35558 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCK1P35558 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCK1P35558 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCK1P35558 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCK1P35558 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCK1P35558 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCK1P35558 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCK1P35558 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCK1P35558 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCK1P35558 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PCK1P35558 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCK1P35558 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCK1P35558 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCK1P35558 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCK1P35558 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCK1P35558 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCK1P35558 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PCK1P35558 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCK1P35558 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PCK1P35558 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCK1P35558 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCK1P35558 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCK1P35558 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCK1P35558 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCK1P35558 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCK1P35558 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCK1P35558 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCK1P35558 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCK1P35558 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK1P35558 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK1P35558 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK1P35558 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK1P35558 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK1P35558 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK1P35558 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK1P35558 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK1P35558 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK1P35558 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCK1P35558 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCK1P35558 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK1P35558 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK1P35558 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK1P35558 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK1P35558 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK1P35558 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK1P35558 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK1P35558 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCK1P35558 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms