Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXD13P35453 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXD13P35453 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD13P35453 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD13P35453 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms