Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC2P35250 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC2P35250 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFC2P35250 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC2P35250 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC2P35250 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC2P35250 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC2P35250 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC2P35250 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC2P35250 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFC2P35250 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC2P35250 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC2P35250 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC2P35250 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC2P35250 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC2P35250 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC2P35250 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC2P35250 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC2P35250 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC2P35250 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFC2P35250 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC2P35250 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC2P35250 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC2P35250 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC2P35250 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC2P35250 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC2P35250 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC2P35250 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFC2P35250 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC2P35250 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC2P35250 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC2P35250 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC2P35250 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC2P35250 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC2P35250 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFC2P35250 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC2P35250 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC2P35250 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC2P35250 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC2P35250 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC2P35250 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC2P35250 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFC2P35250 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC2P35250 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC2P35250 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC2P35250 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC2P35250 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC2P35250 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC2P35250 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC2P35250 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFC2P35250 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC2P35250 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC2P35250 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC2P35250 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC2P35250 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC2P35250 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC2P35250 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFC2P35250 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC2P35250 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC2P35250 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC2P35250 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC2P35250 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC2P35250 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFC2P35250 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC2P35250 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC2P35250 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC2P35250 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC2P35250 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC2P35250 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC2P35250 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC2P35250 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC2P35250 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFC2P35250 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC2P35250 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC2P35250 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC2P35250 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC2P35250 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC2P35250 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC2P35250 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC2P35250 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFC2P35250 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC2P35250 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC2P35250 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC2P35250 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC2P35250 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RFC2P35250 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC2P35250 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC2P35250 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC2P35250 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC2P35250 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC2P35250 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC2P35250 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC2P35250 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC2P35250 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFC2P35250 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFC2P35250 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RFC2P35250 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFC2P35250 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFC2P35250 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFC2P35250 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms