Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR1P32246 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR1P32246 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR1P32246 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR1P32246 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR1P32246 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR1P32246 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR1P32246 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR1P32246 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR1P32246 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR1P32246 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR1P32246 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR1P32246 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR1P32246 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR1P32246 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR1P32246 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR1P32246 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR1P32246 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR1P32246 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCR1P32246 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR1P32246 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCR1P32246 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR1P32246 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR1P32246 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR1P32246 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR1P32246 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR1P32246 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR1P32246 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR1P32246 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR1P32246 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR1P32246 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR1P32246 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR1P32246 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR1P32246 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCR1P32246 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR1P32246 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR1P32246 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR1P32246 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR1P32246 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR1P32246 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR1P32246 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR1P32246 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR1P32246 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR1P32246 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR1P32246 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR1P32246 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR1P32246 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR1P32246 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR1P32246 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR1P32246 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR1P32246 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR1P32246 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR1P32246 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR1P32246 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR1P32246 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR1P32246 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR1P32246 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR1P32246 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR1P32246 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR1P32246 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR1P32246 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR1P32246 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR1P32246 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR1P32246 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR1P32246 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR1P32246 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR1P32246 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR1P32246 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR1P32246 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR1P32246 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR1P32246 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR1P32246 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR1P32246 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR1P32246 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR1P32246 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR1P32246 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR1P32246 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR1P32246 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR1P32246 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR1P32246 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR1P32246 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCR1P32246 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR1P32246 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR1P32246 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR1P32246 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR1P32246 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR1P32246 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR1P32246 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR1P32246 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR1P32246 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR1P32246 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR1P32246 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR1P32246 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR1P32246 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR1P32246 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR1P32246 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR1P32246 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR1P32246 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR1P32246 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR1P32246 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms