Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC27P30260 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC27P30260 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC27P30260 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC27P30260 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC27P30260 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC27P30260 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC27P30260 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC27P30260 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC27P30260 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC27P30260 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC27P30260 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC27P30260 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC27P30260 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC27P30260 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC27P30260 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC27P30260 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC27P30260 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC27P30260 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC27P30260 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC27P30260 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC27P30260 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC27P30260 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC27P30260 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC27P30260 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC27P30260 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC27P30260 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC27P30260 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC27P30260 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC27P30260 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC27P30260 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDC27P30260 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDC27P30260 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC27P30260 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC27P30260 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC27P30260 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC27P30260 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC27P30260 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC27P30260 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC27P30260 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC27P30260 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC27P30260 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC27P30260 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC27P30260 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC27P30260 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC27P30260 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC27P30260 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC27P30260 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC27P30260 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC27P30260 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC27P30260 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC27P30260 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC27P30260 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC27P30260 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC27P30260 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC27P30260 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC27P30260 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC27P30260 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC27P30260 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC27P30260 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC27P30260 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC27P30260 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC27P30260 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC27P30260 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC27P30260 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC27P30260 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC27P30260 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC27P30260 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC27P30260 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC27P30260 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC27P30260 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC27P30260 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC27P30260 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC27P30260 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC27P30260 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC27P30260 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC27P30260 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC27P30260 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC27P30260 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC27P30260 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC27P30260 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC27P30260 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC27P30260 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC27P30260 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC27P30260 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC27P30260 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC27P30260 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC27P30260 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms