Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHB2P29323 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EPHB2P29323 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPHB2P29323 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms